本博物館では, 毎年1回ずつ特別企画展を開催している。1997年から「遺物に刻まれた古代文字」, 「三国時代の動物園」, 「重要文化遺跡発掘写真展」, 「韓国古代国家の形成」, 「古代装身具」, 「考古学が探した先史と伽耶」, 「古代戦士と武器」, 「金！金！金！の話」, 「出会い-古代アジア文物交流展」, 「技術の発見」, 「金官伽耶と新羅」, 「先史, 古代の料理」, 「豊穣と安寧の祈願-先史, 古代の祭事」, 「もう一つの道具-骨角器」, 「考古学から見る釜山の歴史」, 「神の鏡-銅鏡」, 「履, 古代人の履き物」, 「先史・古代の貝塚 - 人間, 海, そして生」, 「先史・古代の玉の世界」, 「古代の言語, 絵」 等，全国から遺物を集めて企画展示を行った。